BioC2 ist ein vom Forum der Universität zu Köln gefördertes Projekt mit einer Laufzeit von zwei Jahren.

Der anthropogene globale Klimawandel hat zu einem alarmierenden Rückgang der biologischen Vielfalt, einem massiven Verlust natürlicher Lebensräume und dem kollateralen Rückgang von Ökosystemdienstleistungen geführt. Die Bewältigung dieser Krise erfordert ein grundlegendes Verständnis der biologischen Vielfalt, ihrer Funktionen und Beziehungen auf allen Ebenen der biologischen Organisation, vom Genom eines einzelnen Organismus bis zum Ökosystem. Darüber hinaus warten trotz der Forschungsbemühungen 80% der mehrzelligen Arten weltweit immer noch auf eine wissenschaftliche Entdeckung und Beschreibung.

Eine BioC2-Serverplattform für die öffentliche Veröffentlichung von Genomprojekten, zugehörigen Datenbanken und Analyseinfrastrukturen soll entwickelt werden. Wir folgen den Prinzipien der "Open Science" und ermöglichen den Zugang zu allen genomischen Daten und den damit verbundenen Metadaten. In Zusammenarbeit mit dem Darwin Tree of Life-Projekt und dem European Reference Genome Atlas werden Links zu internationalen Datenbanken entwickelt.

Die Rolle der Universität zu Köln und des RRZK in Bio C2

Langfristiges Ziel ist es, ein Biodiversitätszentrum in Köln zu etablieren, das Genome der gesamten deutschen Biodiversität sequenziert, annotiert und veröffentlicht. BioC2 ist eine Koopeeration von Zoologen (des Biozentrums und Instituts für Zoologie), Sequenzierungsexperten (am CCG/WGGCI und dem MPI-PZ) und HPC-Experten (Peter Heger und Viktor Achter am RRZK).

Im Laufe des Projekts werden mehrere hochwertige Referenzgenome von Schlüsselarten aus niederrheinischen Lebensräumen gesammelt und aufbereitet, sequenziert, assembliert und annotiert. Wir tragen mitComputer- und Software-Infrastruktur für die Assemblierung und Annotation der neu sequenzierten Genome zum Projekt bei.

Assoziierte Partner & weiterführende Links

Viktor Achter

Peter Heger

Darwin Tree of Life project  

European Reference Genome Atlas   

Forum of the University of Cologne

More Information: Waldvogel Lab

Diese Projektwebsite wurde von Leandro Dillmann und Matti Ramm im Rahmen ihres Schülerpraktikums am 07.02.2024 erstellt.