Archiv abgeschlossener Projekte
KA³ - Kölner Zentrum Analyse und Archivierung von AV- Daten
BMBF-Förderkennzeichen: 01UG1511A
In den Geistes- und Sozialwissenschaften sind multimodale Daten von zunehmender Bedeutung. Auswertung, Dokumentation, Publikation und Archivierung sind Technologien, die im Kontext der Geistes- und Sozialwissenschaften bisher noch wenig erforscht sind, denn ein maßgeblicher Einsatz von Transkriptionen stellt das bis dato primäre Medium zur Repräsentation dieser Daten dar.
Im KA³-Projekt wird ein fach- und standortübergreifendes Kölner Zentrum für Analyse und Archivierung audiovisueller Daten aufgebaut. Dabei wird der Fokus auf die interaktionsbezogene Strukturierung und effiziente Bereitstellung von audiovisuellen Daten gesetzt.
Das RRZK wird im KA³-Projekt am Auf- /Ausbau eines überregionalen Onlinearchivs mitwirken und die eigenen Erfahrungen im Bereich Softwareentwicklung, Nachhaltigkeit und Betrieb einbringen. Die Leistungsfähigkeit und zukunftssichere Konzeption ist ein wichtiges Ziel im Projekt. Die Nutzerinnen und Nutzer zugleich in Ihren Anwendungsszenarien zu unterstützen ist eine zentrale Anforderung, die durch agile Vorgehensweise der Diensteentwicklung gewährleistet wird.
Kontakt: Christoph Stollwerk und Prof. Dr. Ulrich Lang
Projektbeteiligte:
- Universität zu Köln:
Institut für Linguistik – Prof. Dr. Nikolaus Himmelmann
RRZK (Regionales Rechenzentrum der Universität zu Köln) – Prof. Dr. Ulrich Lang
Kölner Datenzentrum für Geisteswissenschaften - Externe Kooperationspartner:
Fernuniversität Hagen, Institut für Geschichte und Biographie
Fraunhofer Institut für Intelligente Analyse- und Informationssysteme
Max-Planck-Institut für Psycholinguistik
Projektlaufzeit: Phase 1: 01.10.2015 - 31.09.2018; Phase 2: 01.10.2018 - 31.09.2020
High Definition Clouds and Precipitation for Advancing Climate Prediction HD(CP)2
BMBF-Förderkennzeichen: Phase 1: 01LK1211C; Phase 2: 01LK1502A
Das Projekt 'High Defnition Clouds and Precipitation for Advancing Climate Prediction' - HD(CP)² ist eine vom Bundesministerium für Bildung und Forschung geförderte Forschungsinitiative, deren Aufgabe im besseren Verständnis der physikalischen Prozesse von Luftfeuchtigkeit und Wolkenbildung liegt. Auf der Basis neu gewonnener, vielfältiger, hochwertiger Messdaten und neuer Simulationsmodelle soll dann eine exaktere Klimavorhersage möglich sein. Der Beobachtungs- und Messbereich von HD(CP)² umfasst im wesentlichen Deutschland und die Niederlande.
Im Teilprojekt O3 HD(CP)²-Integration ist die Organisation der meteorologischen Messdaten in einem auch für die Öffentlichkeit zugänglichen Datenarchiv ein wesentliches Ziel. Die Implementierung der hierzu notwendigen Infrastruktur sowie die Entwicklung von Diensten wie beispielsweise die Metadaten-Erfassung, die Qualitätssicherung der Daten, und die statistische Auswertung von Zugriffen sind Aufgaben des RRZK.
Kontakt RRZK: Volker Winkelmann
Partner im Teilprojekt O3:
- Universität zu Köln (RRZK & IGMK)
- Universität Hamburg
- Universität Bonn
- FU Berlin
- FZ Karlsruhe
- LMU München
- Leibniz-Institut für Troposphärenforschung Leipzig
- MPI für Meteorologie Hamburg
- FZ Jülich
- Deutscher Wetterdienst
- Deutsches Klimarechenzentrum
- The Royal Netherlands Meteorological Institute
- University of Basilicata & andere.
Projektlaufzeit: Phase 1: 01.10.2012 - 30.9.2015, verlängert bis 31.03.2016; Phase 2: 01.04.2016 - 31.3.2019, verlängert bis 31.12.2019
SMOOSE - Verbundprojekt: Systemische Analyse von Modulatoren der onkogenen Signalübertragung
BMBF-Förderkennzeichen: 01ZX1303A
Im Bereich der Onkologie wird die Identifizierung neuer genetischer/molekularer Marker mit Next-Generation Sequenzierung und Whole-Genome Sequenzierung die Art und Weise verändern, wie wir Krebs in Zukunft behandeln und diagnostizieren werden. Personalisiertes Gesundheitswesen wird wahrscheinlich die zukünftige Realität in der Behandlung von Patienten werden. Jedoch, ist der Erfolg des personalisiereten Gesundheitswesens durch erworbene Resistenz und Primäre Resistenz beschränkt. Das SMOOSE Projekt schlägt einen multi-disziplinären Ansatz vor, der Informatik und Bioinformatik, Molekular Biologie, molekulare Tumorbiologie und (Epi-)genetik, genetisch manipulierte Mäuse, chemische und strukturelle Biologie, molekulare Pathologie und medizinische Onkologie beinhaltet.
Durch das RRZK soll die Infrastruktur entlang der Verarbeitungspipeline durch Methoden aus dem High-Performance Computing (HPC) unterstützt werden. Rechen- und Datenbankinfrastruktur werden benötigt, um effizientes Datenmanagement von großen genetischen Datenmengen, wie bei genetischer Sequenzierung, sicherzustellen. Die Verarbeitung von großen Datenmengen beinhaltet optimierte Algorithmen und Analyse-Pipelines. Ziel ist es hierbei, eine spezialisierte Appliance zu bauen, die deutlich geringere Anforderungen an Infrastruktur und Personal stellt.
Kontakt: Viktor Achter
Projektbeteiligte:
- Universität zu Köln:
Department of Translational Genomics - Roman Thomas und Martin Peifer
Institut für Informatik und Regionales Rechenzentrum - Ulrich Lang
Institut für theoretische Physik - Johannes Berg - Universitätsklinik Köln:
Klinik für Kinderonkologie und -hämatologie - Matthias Fischer
Klinik I für Innere Medizin - Christian Reinhardt und Jürgen Wolf
Institut für Pathologie - Reinhard Büttner - Universitätskinderklinik Essen:
Pädiatrisch-Onkologische Forschung II - Johannes Schulte - Technische Universität Dortmund:
Institut für Chemie und chemische Biologie - Daniel Rauh
Projektlaufzeit: Antragstellung über 5 Jahre. Erster bewilligter Zeitraum 01.01.2014 - 31.12.2016, planmäßige Erweiterung 01.01.2017 - 31.12.2018
Erlassdatenbank der Universität zu Köln
Die Verteilung von an die Universität zu Köln adressierten Erlassen verschiedener staatlicher Stellen ist eine große (verwaltungs-)logistische Herausforderung. Zumeist müssen mehreren Dezernaten, Fakultäten und weitere Stellen komplexe Informationen zugänglich gemacht werden. Gleichzeitig müssen interne und externe Fristen organisiert und gehalten werden.
In Zusammenarbeit mit der Diensteentwicklung des RRZK entwickelt zu diesem Zweck die Abteilung 34 (Innerer Dienst und Beihilfeservice) ein neues Werkzeug für das Erlassmanagement. Die so entstehende Erlassdatenbank (Erlassbuch) verwaltet zur Zeit schon über 10.000 Erlasse in digitaler Form, die zurück bis in das Jahr 1998 reichen und aus einem schon bestehenden Datenbestand migriert wurden. Sie stellt die effiziente Informationsweitergabe an federführende, beteiligte und zu informierende Stellen innerhalb der Universität sicher. Ein differenziertes Rollen- und Berechtigungskonzept mittels Zugriffssteuerungslisten (Access Control Lists) stellt die Vertraulichkeit der zu zirkulierenden Informationen sicher. Alle Erlasse werden dauerhaft archiviert und zu Recherchezwecken durchsuchbar gemacht. Die Erlasse können nach verschiedensten Kriterien (auch in Kombination) gezielt gefiltert werden, so dass eine eingeschränkte Suche, zum Beispiel nach Absender, Zeitraum, Aktenzeichen oder Stichwort möglich ist.
Kontakt:
Projektbeteiligte: Abteilung 34 (Innerer Dienst und Beihilfeservice): Guido Kirfel
Projektlaufzeit: 01.09.2015 - 31.12.2017
Projektwebseite: Erlassbuch der Universität zu Köln
Berufungsportal der Universität zu Köln
Das Berufungsportal unterstützt die zur Durchführung von Berufungsverfahren notwendigen Arbeitsschritte für die Fakultäten, insbesondere die Kommunikation mit Mitgliedern der Berufungskommission und Gutachtern. Sobald eine Professur ausgeschrieben wird, bündelt das Portal nahezu alle Aktivitäten rund um das weitere Berufungsverfahren an der Universität zu Köln. In einer Webanwendung wird die entsprechende Ausschreibung veröffentlicht. Stellenanzeigen in den üblichen Medien (Print, Web, Social Media, …) verweisen auf diese Webseite. Bewerber_innen wird dort eine einheitliche Dateneingabe über strukturierte Formulare und das Hinterlegen von Anlagen und Publikationen zur Bewerbung ermöglicht. Die dann in einem einheitlichen Format vorliegen Bewerbungen lassen sich im weiteren Verlauf durch die am Verfahren Beteiligten (Gutachter_innen, Kommissionen, Mitarbeiter_innen der Fakultäten, …) wesentlich effizienter bearbeiten.
Die Diensteentwicklung des RRZK hat sich auf die Entwicklung von webbasierten Softwarelösungen im universitären Bereich spezialisiert. Sie stellt im Projekt die technische Projektleitung und entwickelt das Berufungsportal in Zusammenarbeit mit den Fakultäten und zentralen Einrichtungen der Universität. Die Entwicklung des Berufungsportals erfolgt iterativ auf der Grundlage der Methodik agiler Softwareentwicklung.
Kontakt:
Robert Kummer
Michael Lönhardt
Projektbeteiligte
- Stabsstelle 03 (Universitätsverwaltung, Berufungen): Irmgard Hannecke-Schmidt
- Wirtschafts- & Sozialwissenschaftliche Fakultät: Michael Müller
- Rechtswissenschaftliche Fakultät: Dekanat
- Medizinische Fakultät: Dagmar Gold
- Philosophische Fakultät: Anne Biermann
- Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät: Anna Bode
- Humanwissenschaftliche Fakultät: Dekanat
Projektlaufzeit: seit 01.07.2014
Projektwebsite Berufungsportal
The Cancer Systems Biology Database (CancerSysDB)
BMBF-Förderkennzeichen: LA919/6-1
Das Ziel dieses Projektes ist die Entwicklung einer deduktiven Datenbank, welche die Integration unterschiedlicher Typen und Quellen von hochdimensionalen molekularen Tumordatensätzen ermöglicht. Dabei nähern wir uns dem Ziel einer systembiologischen Betrachtung von Krebszellen durch die gemeinsame Betrachtung etwa von genomischen Daten und Expressionsdaten. Ferner ermöglicht das System dem Nutzer nicht nur die Speicherung und Analyse seiner eigenen Forschungsdaten, sondern auch die vergleichende Betrachtung mit Daten aus anderen Forschungsdatenrepositorien zur Krebsgenomik. Dieses System wird die Breite an Informationen, welche bei der Betrachtung von Forschungsdaten verfügbar sind, enorm vergrößern und neue Möglichkeiten des wissenschaftlichen Erkenntnisgewinns eröffnen. Das System wird einerseits in einer öffentlichen Instanz realisiert, in welcher die Daten und Analysemöglichkeiten - den jeweiligen Beschränkungen entsprechend - jedem Nutzer zugänglich sind. Andererseits kann jede Institution bei entsprechendem Bedarf eine eigene lokale Instanz betreiben, um das System für die nicht öffentliche Betrachtung seiner eigenen Forschungsdaten zu nutzen.
Kontakt RRZK: Diensteentwicklung am RRZK, CECAD Bioinfo
Projektbeteiligte:
- CECAD Bioinformatics Core Facility, Köln
- Bioinformatics Core Unit am Max Planck Institut für Biochemie, Martinsried
- Regionales Rechenzentrum der Universität zu Köln
- Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)
Projektlaufzeit: Herbst 2013 - 01.02.2017
FAST - Find a Suitable Topology for Exascale Applications
BMBF-Förderkennzeichen: 01lH13004D
FaST ist ein Forschungsprojekt, das vom Bundesministerium für Bildung und Forschung gefördert wird. Es beschäftigt sich mit der zeitlichen und räumlichen Platzierung von Prozessen in Hochleistungsrechnern der Zukunft. Es wird angenommen, dass sich der aktuelle Trend in der Hardwareentwicklung fortsetzen wird und die CPU-Leistung deshalb deutlich schneller als andere Ressoucen wie die I/O-Leistung wachsen wird. Um zu verhindern, dass diese Ressourcen zu Engpässen im System werden, soll ein neues Scheduling-Konzept entwickelt werden, das die Systemressourcen überwacht und lokale Anpassungen an der Jobverteilung vornimmt. Die Überwachung des Systems wird durch ein neu entwickeltes Agentensystem realisiert, die Anpassung der Jobzuweisungen durch Prozessmigration. Die Leistungsfähigkeit des Ansatzes wird in den Beispielanwendungen LAMA und mpiBLAST demonstriert.
Das Ziel ist die prototypische Evaluation des im FAST-Projekt entwickelten Systems anhand von ausgewählten Anwendungen. Hierbei wird zum Beispiel eine Anwendung aus dem Gebiet der Lebenswissenschaften eingesetzt. Das RRZK wird den Einfluss der Entwicklungen des Projekts auf das Laufzeitverhalten der betrachteten Modellanwendungen evaluieren.
Kontakt: Viktor Achter
Projektbeteiligte:
- Johannes Gutenberg-Universität Mainz: Zentrum für Datenverarbeitung (JGU) - Prof. Dr.-Ing. André Brinkmann und Dr. Lars Nagel
- Technische Universität München: Lehrstuhl für Rechnertechnik und -organisation (TUM) - Prof. Dr. rer. nat. Dr.-Ing. habil. Arndt Bode, Prof. Dr.-Ing. Carsten Trinitis und Dr. rer. nat. Josef Weidendorfer
- Universität zu Köln: Regionales Rechenzentrum - Prof. Dr. Ulrich Lang
- Fraunhofer-Institut für Algorithmen und wissenschaftliches Rechnen (SCAI): Dr. Thomas Soddemann
- RWTH Aachen University: Lehrstuhl für Betriebssysteme - Dr. rer. nat. Stefan Lankes
- MEGWARE Computer Vertrieb und Service GmbH: Jürgen Gretzschel
- ParTec Cluster Competence Center GmbH: Hugo Falter
Projektlaufzeit: 01.01.2015 - 31.12.2016
NGSgoesHPC - Genomanalyse trifft wissenschaftliches Hochleistungsrechnen
BMBF-Förderkennzeichen: 01IH11003A
Das Projekt NGSgoesHPC beschäftigt sich damit, für die NGS-Prozesse (next generation sequencing) entscheidende Anwendungen und Kernel-Algorithmen auf moderne Hochleistungsinfrastrukturen (HPC) zu portieren.
NGS gilt als Schlüsseltechnologie der Genetik zur Bestimmung genetischer Informationen. Durch die NGS Technologie wird es möglich, eine Vielzahl an Fragestellungen zu behandeln, für die bisherige Sequenziermethoden zu kosten- und zeitaufwendig waren: die beim Prozess der Sequenzierung entstehenden großen Datenmengen können mit Hilfe von Hochleistungsrechnern verarbeitet und interpretiert werden.
NGSgoesHPC wird auf dem Gebiet der genetischen Forschung neue Möglichkeiten eröffnen, um Anwendungen an moderne Hardwarearchitekturen anzupassen und neue Methoden zur Verarbeitung und Darstellung der Ergebnisse zu entwickeln.
Projektbeteiligte:
- ATLAS Biolabs GmbH
- Biotechnologisches Zentrum (TU Dresden)
- Bull GmbH
- Cologne Center for Genomics
- DataDirect Networks GmbH
- Forschungszentrum Jülich
- Intel GmbH
- Max-Planck-Institut für Biologie des Alterns
- Zentrum für Informationsdienste und Hochleistungsrechnen (TU Dresden)
Projektlaufzeit: 01.06.2011 - 31.05.2014
Villa Domitian in Castel Gandolfo
In Zusammenarbeit mit dem Archäologischen Institut der Universität zu Köln rekonstruieren, visualisieren und analysieren wir mehrere wichtige Kulturerbestätten auf dem heutigen Gelände der päpstlichen Sommerresidenz in Castel Gandolfo in der Nähe der italienischen Hauptstadt Rom. Die Residenz wurde auf den Ruinen der Sommerresidenz des römischen Kaisers Domitian (51 - 96) errichtet, auf einer Fläche von 14 km2. Das obere Bild zeigt eine 3D-Rekonstruktion des Kryptoportikus. Entlang der zur Sonne gewandten Wand auf der linken Seite entstehen durch die besondere Anordnung der Fenster Lichteffekte in Form von Lichtschranken. Gäste und Bittsteller mussten einen 300 Meter langen Weg durch diese Lichtschranken zurücklegen, um zum Kaiser zu gelangen. Das untere Bild zeigt unseren ersten Entwurf des nahegelegenen Theaters.
Finanzierung:
- Interne Finanzierung 2004-2009
- Feldforschungsarbeit gefördert durch die Gerda-Henkel-Stiftung und die Fritz-Thyssen-Stiftung
Aktuell:
Informationen zu Tools für kollaboratives Arbeiten im Homeoffice
Kontakt
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