Rechnen auf mehreren Knoten
Das Rechnen auf mehreren Knoten ermöglicht Ihnen eine weitere Parallelisierung und damit Beschleunigung der Rechnung. Wenn Sie größere Rechnungen durchführen wollen, sollten Sie diese Methode des Rechnens erwägen. Dafür sollten Sie das Slurm-Skript und die Gaussian 09-Inputdatei anpassen:
SLURM-Skript
Entscheiden Sie sich zuerst für eine Knotengruppe und tragen Sie diese in das Slurm-Skript ein.
#!/bin/bash -l
#SBATCH --constraint=inca8
#SBATCH --nodes=2
#SBATCH --ntasks-per-node=8
#SBATCH --mem=22000
#SBATCH --time=02:00:00
#SBATCH --account=UniKoeln
In diesen Beispiel werden 2 Knoten der Gruppe inca8 mit jeweils 8 Kernen und einen Gesamtarbeitsspeicher von 22000 Megabyte angefordert. In den meisten Fällen ist die Angabe der Knotengruppe optional, da Slurm automatisch die geeigneteste Knotengruppe auswählt.
Gaussian-Eingabedatei
Verwenden Sie für das Rechnen auf mehren Kernen unter Gaussian den Befehl nproclinda.
%mem=20GB
%nprocshared=8
%nproclinda=2
%chk=name.chk
Das link0-Kommando nprocshared gibt die auf jedem Knoten benutzte Anzahl von Prozessoren an. nproclinda bestimmt die Anzahl der benutzten Knoten.
Beide Angaben müssen mit denen im Slurm-Skript übereinstimmen, andernfalls wird die Rechnung nicht durchgeführt.
Aktuell:
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